Лечение эндоцервицита обыкновенно проводится в два этапа. Вначале требуется устранить возбудителя инфекции, с этой целью врач подберет системный антибиотик, способный воздействовать на конкретного возбудителя. После избавления от инфекции следует восстановить равновесие между лактофлорой и микроорганизмами, чтобы избежать рецидива. Необходимо учитывать, что терапия пройдет успешно только если будут ликвидированы все остальные воспалительные гинекологические недуги.